בשל האופי הנדיף והדליק של אתיל אצטט, השימוש והאחסון שלו חייבים לעמוד בתקנות הבטיחות:
הגנה תפעולית: פעולות חייבות להתבצע בסביבה-מאווררת היטב כדי להימנע משאיפת כמויות גדולות של אדים; להרחיק מלהבות פתוחות ומציוד-בטמפרטורה גבוהה; העישון אסור באזור הניתוח; ללבוש משקפי מגן וכפפות ניטריל במידת הצורך כדי למנוע מגע עור עם הנוזל.
דרישות אחסון: אחסן במיכל אטום במחסן קריר, יבש ומאוורר- היטב, כשהטמפרטורה נשלטת מתחת ל-30 מעלות, הרחק ממקורות הצתה, מקורות חום וחומרי חמצון (כגון אשלגן פרמנגנט ואשלגן כלורט); השתמש בבקבוקי זכוכית עמידים בפני קורוזיה- או בתופי פלסטיק לאחסון, והימנע מאחסנה עם חומצות חזקות או אלקליות.
טיפול במצבי חירום: במקרה של דליפה, סגור מיד את מקורות ההצתה; לספוג את החומר שדלף בחול או בחומר סופג אינרטי כדי למנוע זרימת נוזל לביוב; אם נשאפות כמויות גדולות של אדים, עברו במהירות לאוויר צח ופנו מיד לטיפול רפואי אם מתרחשת אי נוחות; אם הנוזל ניתז לעיניים, יש לשטוף מיד בהרבה מים למשך 15 דקות לפחות.
